從氣流流向分為：垂直流潔凈工作臺和水平流潔凈工作臺；潔凈工作臺從操作人員數(shù)上分：分為單人工作臺和雙人工作臺；潔凈工作臺從結(jié)構(gòu)上分：分為常規(guī)型和新型推拉以及自循環(huán)型（僅限垂直流）。
潔凈工作臺根據(jù)氣流的方向分為垂直流潔凈工作臺(vertical flow clean bench)和水平流潔凈工作臺(horizontal flow clean bench)，垂直流工作臺由于風機在頂部所以噪音較大但是風垂直吹多用在醫(yī)藥工程這樣保證人的身體健康；水平流工作臺噪音比較小風向往外所以多用在電子行業(yè)，對身體健康影響不大。根據(jù)操作結(jié)構(gòu)分為單邊操作及雙邊操作兩種形式，按其用途又可分為普通潔凈工作臺和生物(醫(yī)藥)潔凈工作臺。